黑旗在八旗制度建立前去了哪里？为什么会消失不见
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公元1559年的初春，一个婴儿降生在今辽宁省新宾县境内一个小酋长家里，这便是后来的一代枭雄努尔哈赤，57年后，年逾花甲的他在自己出生的地方建立后金，割据辽东，建元天命。在他为事业打拼的这几十年中，努尔哈赤的长子褚英，为他立下了汗马功劳。
相传褚英曾在一次夜行军时，偶遇一道白光击在了队伍旗帜之上，众人都以为是不祥之兆欲撤军，唯有褚英坚持继续行军，给敌人致命一击，后来经过激烈的战斗，褚英获得胜利，很多人便又将这道白光视作吉照。或许正是因为这件事，努尔哈赤在奖赏褚英时，特意将新归附的军事力量划给了他并建立了一支独立的队伍——白旗。
努尔哈赤亲自统领的红旗，与亲弟弟舒尔哈齐统领的黑旗，以及长子褚英统领的白旗，是这支女真部落初期核心的武装力量，地位极为重要。但和所有老皇帝一样，努尔哈赤也遇到了帝王家父与子的诅咒，老皇帝喜新厌旧，新人阿巴亥(1590年-1626年)年轻貌美，宠幸后生下了三个幼子，老来得子自然分外疼爱，与之相反对已经成年的儿子们多少有了些提防，尤其是自己的长子褚英。
因为如果褚英和舒尔哈齐联手，那么等待努尔哈赤的结局不言而喻，正是看清楚两这点，努尔哈赤手底下的大臣们便替努尔哈赤说出的心中的担忧，并有模有样的描绘出了他想要听到的证据，于是褚英和舒尔哈齐分别被努尔哈赤于1615年(见注释1)和1611年处死。
连带着曾经被褚英和舒尔哈齐领导的白旗和黑旗，也被努尔哈赤重新划分，这才有了后来的满洲八旗。
消失了的黑旗，与一分为三的白旗秋闰八月，帝长子褚英卒……初以黄、红、白、黑四旗统兵，至是增四镶旗，易黑为蓝……——《清史稿》
作为领导既要懂得充分放权，尤其是在创业初始阶段，同时也要注意不要让权力在某个下属身上过于集中，不论褚英还是舒尔哈齐，之所以会被努尔哈赤猜忌，预期手中兵权过大有着重要关系。吸取两这次教训，努尔哈赤在重新划分八旗军所属的问题上，着实花了一番心思。
首先努尔哈赤将长子褚英缔造的白旗一分为三，正蓝旗(21个牛录，见注释2)交给自己的第五个儿子莽古尔泰，正白旗(18个牛录)则交由第八子皇太极统领，镶白旗(15个牛录)留给了褚英长子杜度，之所以这么做，一方面因为杜度是自己的孙子，不能因为儿子的问题就牵连自己的孙子。
另一方面褚英之死和几大贝勒以及元老重臣有着重要关系，杀父之仇不共戴天，虽然动手的是自己的爷爷，但栽赃陷害的小人却是这些人，所以杜度与这些人存在不可调和的矛盾，自然不会走到一块喝努尔哈赤做对。
舒尔哈齐的黑旗，同样也被一分为三，正红旗(25个牛录)交给了努尔哈赤次子代善，镶红旗(26个牛录)则让代善长子岳托管理，镶蓝旗(33个牛录)由舒尔哈齐的儿子阿敏，也就是努尔哈赤的侄子率领，其目的和前面提到杜度有些类似。所以在阿敏死后，又改由舒尔哈齐的儿子济尔哈朗统领。
而当初努尔哈赤自己统帅的红旗也一分为二，成为后来赫赫有名的正黄旗(45个牛录)和镶黄旗(20个牛录)。努尔哈赤通过这一次军队管辖权的划分，即在一定程度上充分授权，有对手下人的军权进行了一定的分散，从根本上避免了一家独大的情况发生，也保证了后来几次皇权交接的顺利。
杀了长子，宠幸幼子，意外死亡便宜了第八子
之前提到，努尔哈赤之所以会下狠心除掉长子褚英，有一部分原因是宠幸阿巴亥，溺爱幼子促使的，所以完善八旗制度后，努尔哈赤甚至将手中一部分正黄旗兵权交在了三个幼子手中，尤其是对最小的儿子多铎，简直到了突破常理的地步。
多铎出生于公元1614年，六岁的时候便被封为和硕额真，十二岁时封贝勒统正黄旗，当然在《清史稿》记载是正白旗，这就要解释下原因了。在努尔哈赤去世后，继位的是第八子皇太极，为了延续皇帝亲统两黄旗的传统，于是便用他自己手中的正白旗，换回了多铎手中的正黄旗，这其实有些以大欺小的嫌疑，属于典型的家丑，而根据后世乾隆的作风，很可能就索性将多铎继承正黄旗的事件抹去，直接换为了正白旗，好为皇太极遮丑。
但这从逻辑上就很难自洽了，一是作为努尔哈赤第八子的皇太极是正白旗旗主，又没犯过什么大错，努尔哈赤没理由剥夺他掌握的正白旗，再赐给幼子多铎。二是多铎是努尔哈赤的最小的孩子，根据幼子守业的传统，努尔哈赤将正黄旗提前交给多铎名正言顺(可以参考成吉思汗死前将手中的军队交给了幼子托雷)。
但老谋深圳的努尔哈赤没有想到自己的意外死亡，幼子羽翼尚未丰满，只能在哥哥们的威势面前妥协，不得不让出了手中的正黄旗。出来混，总是要还的，纵使努尔哈赤最疼爱幼子，在他撒手人寰以后，等待幼子的命运就不再由他说了算了。
